Le premier semestre de deuxième année présente les différents domaines d'applications de la chimie : matériaux, polymères, biochimie, énergie).
Le deuxième semestre propose un choix de cinq options au second semestre : analytical and biological chemistry (en anglais), procédés, materials (en anglais), chimie moléculaire, biotechnologies (en échange avec l’ESPCI). Les enseignements deviennent plus approfondis dans chaque option.
Les cours de management sont axés sur la vie et le travail dans l'entreprise.
Les élèves réalisent un projet d’innovation en groupe sur toute l’année. Ce projet est soumis par un client. Le projet est découpé en trois phases : inspiration, élaboration, réalisation. Pendant le premier semestre ils écrivent un cahier des charges et ils étudient l’état de l’art et la littérature (scientifique, brevet, internet). Ils élaborent une proposition innovante qu’ils font valider par leur comité de pilotage. Pendant le second semestre ils réalisent un prototype prouvant la faisabilité de leur proposition.
De début Avril à fin Aout, les élèves font un stage de 5 mois en entreprise ou en université, en France ou à l’étranger.